Swiss-Protデータファイルの読み方
ここではP18108を例に内容を説明する。
ID GLUC_DIDMA STANDARD; PRT; 29 AA.
この配列はGLUC_DIDMAというID番号を持つ29残基のアミノ酸からなる蛋白質である。
AC P18108;
アクセッション番号はP18108である。
DT 01-NOV-1990 (REL. 16, CREATED)
DT 01-NOV-1990 (REL. 16, LAST SEQUENCE UPDATE)
DT 01-NOV-1990 (REL. 16, LAST ANNOTATION UPDATE)
このデータは1990年11月1日に作成され、最後に配列、注釈の更新がおこなわれたのはどちらも同日である。
DE GLUCAGON.
物質名はグルカゴンである。
OS DIDELPHIS MARSUPIALIS VIRGINIANA (NORTH AMERICAN OPOSSUM).
原料となった生物は北アメリカのオポッサムである。
OC EUKARYOTA; METAZOA; CHORDATA; VERTEBRATA; TETRAPODA; MAMMALIA;
OC MARSUPIALIA.
この生物は上記に示すように分類される。
RN [1]
RP SEQUENCE.
RC TISSUE=PANCREAS;
RM 90160042
RA YU J.-H., ENG J., RATTAN S., YALOW R.S.;
RL PEPTIDES 10:1195-1197(1989).
この配列はここに示された文献に掲載されている。
CC -!- FUNCTION: PROMOTES HYDROLYSIS OF GLYCOGEN AND LIPIDS, AND RAISES
CC THE BLOOD SUGAR LEVEL.
この蛋白質はグリコーゲンと脂質の加水分解を促進し、糖の血中濃度を上昇させる働きがある。
CC -!- INDUCTION: PRODUCED IN THE A CELLS OF THE ISLETS OF LANGERHANS
CC IN RESPONSE TO A DROP IN BLOOD SUGAR CONCENTRATION.
血中の糖濃度に反応してランゲルハンス島細胞で合成される。
CC -!- SIMILARITY: BELONGS TO THE GLUCAGON FAMILY.
グルカゴンファミリーに属している。
CC -!- IDENTICAL TO CHICKEN GLUCAGON.
ニワトリのグルカゴンと同一である。
DR PIR; JQ0364; GCOPV.
DR HSSP; P01274; 1GCN.
DR PROSITE; PS00260; GLUCAGON.
PIRのJQ0364、HSSPのP01274、PrositeのPS00260に関連データがある。
KW GLUCAGON FAMILY; HORMONE.
キーワードはグルカゴンファミリーおよびホルモンである。
SQ SEQUENCE 29 AA; 3456 MW; 5003 CN;
29残基のアミノ酸からなり、分子量は3456である。
HSQGTFTSDY SKYLDSRRAQ DFVQWLMST
配列は上記のとおりである。
//
各々のデータは "//" で終了する。
農業生物資源研究所 遺伝資源第二部 前田美紀
(1997.8.21 by mmaeda)